Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SEMA3CQ99985 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SEMA3CQ99985 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SEMA3CQ99985 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEMA3CQ99985 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms