Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUDCD1Q96RS6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUDCD1Q96RS6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms