Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP8Q96LD8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP8Q96LD8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SENP8Q96LD8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP8Q96LD8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP8Q96LD8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP8Q96LD8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP8Q96LD8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP8Q96LD8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP8Q96LD8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP8Q96LD8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SENP8Q96LD8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP8Q96LD8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SENP8Q96LD8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SENP8Q96LD8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SENP8Q96LD8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SENP8Q96LD8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SENP8Q96LD8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SENP8Q96LD8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SENP8Q96LD8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SENP8Q96LD8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SENP8Q96LD8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SENP8Q96LD8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SENP8Q96LD8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SENP8Q96LD8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP8Q96LD8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SENP8Q96LD8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SENP8Q96LD8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SENP8Q96LD8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SENP8Q96LD8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms