Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF7

SMIM8, Small integral membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM8Q96KF7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SMIM8Q96KF7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMIM8Q96KF7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMIM8Q96KF7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMIM8Q96KF7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMIM8Q96KF7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms