Protein–RNA interactions for Protein: Q96JT2

SLC45A3, Solute carrier family 45 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A3Q96JT2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC45A3Q96JT2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC45A3Q96JT2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC45A3Q96JT2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC45A3Q96JT2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms