Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCMH1Q96GD3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCMH1Q96GD3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCMH1Q96GD3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms