Protein–RNA interactions for Protein: Q96DG6

CMBL, Carboxymethylenebutenolidase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMBLQ96DG6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMBLQ96DG6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMBLQ96DG6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMBLQ96DG6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMBLQ96DG6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMBLQ96DG6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMBLQ96DG6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMBLQ96DG6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMBLQ96DG6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMBLQ96DG6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMBLQ96DG6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMBLQ96DG6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMBLQ96DG6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMBLQ96DG6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CMBLQ96DG6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMBLQ96DG6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMBLQ96DG6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMBLQ96DG6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CMBLQ96DG6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms