Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPTQ96BT3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPTQ96BT3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CENPTQ96BT3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPTQ96BT3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPTQ96BT3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPTQ96BT3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPTQ96BT3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPTQ96BT3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CENPTQ96BT3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPTQ96BT3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPTQ96BT3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPTQ96BT3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPTQ96BT3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CENPTQ96BT3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPTQ96BT3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPTQ96BT3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPTQ96BT3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPTQ96BT3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPTQ96BT3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPTQ96BT3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CENPTQ96BT3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPTQ96BT3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPTQ96BT3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CENPTQ96BT3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPTQ96BT3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPTQ96BT3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CENPTQ96BT3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPTQ96BT3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CENPTQ96BT3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms