Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKD1Q969G9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NKD1Q969G9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKD1Q969G9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKD1Q969G9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKD1Q969G9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKD1Q969G9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKD1Q969G9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NKD1Q969G9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKD1Q969G9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKD1Q969G9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKD1Q969G9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKD1Q969G9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKD1Q969G9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKD1Q969G9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKD1Q969G9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NKD1Q969G9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKD1Q969G9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKD1Q969G9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKD1Q969G9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKD1Q969G9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NKD1Q969G9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKD1Q969G9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKD1Q969G9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKD1Q969G9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKD1Q969G9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKD1Q969G9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKD1Q969G9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms