Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX29Q8TEQ0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX29Q8TEQ0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX29Q8TEQ0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX29Q8TEQ0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX29Q8TEQ0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX29Q8TEQ0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX29Q8TEQ0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX29Q8TEQ0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX29Q8TEQ0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNX29Q8TEQ0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNX29Q8TEQ0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNX29Q8TEQ0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNX29Q8TEQ0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SNX29Q8TEQ0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNX29Q8TEQ0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX29Q8TEQ0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SNX29Q8TEQ0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX29Q8TEQ0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNX29Q8TEQ0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNX29Q8TEQ0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNX29Q8TEQ0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNX29Q8TEQ0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNX29Q8TEQ0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SNX29Q8TEQ0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SNX29Q8TEQ0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNX29Q8TEQ0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNX29Q8TEQ0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNX29Q8TEQ0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNX29Q8TEQ0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SNX29Q8TEQ0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SNX29Q8TEQ0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNX29Q8TEQ0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNX29Q8TEQ0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SNX29Q8TEQ0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SNX29Q8TEQ0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
SNX29Q8TEQ0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX29Q8TEQ0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms