Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYCP3Q8IZU3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYCP3Q8IZU3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP3Q8IZU3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP3Q8IZU3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP3Q8IZU3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP3Q8IZU3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP3Q8IZU3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP3Q8IZU3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP3Q8IZU3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP3Q8IZU3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYCP3Q8IZU3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCP3Q8IZU3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCP3Q8IZU3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCP3Q8IZU3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCP3Q8IZU3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCP3Q8IZU3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYCP3Q8IZU3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
SYCP3Q8IZU3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SYCP3Q8IZU3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYCP3Q8IZU3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYCP3Q8IZU3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYCP3Q8IZU3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms