Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV76

PASD1, Circadian clock protein PASD1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASD1Q8IV76 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PASD1Q8IV76 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PASD1Q8IV76 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PASD1Q8IV76 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PASD1Q8IV76 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PASD1Q8IV76 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PASD1Q8IV76 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PASD1Q8IV76 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PASD1Q8IV76 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PASD1Q8IV76 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PASD1Q8IV76 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PASD1Q8IV76 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PASD1Q8IV76 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PASD1Q8IV76 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PASD1Q8IV76 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PASD1Q8IV76 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PASD1Q8IV76 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PASD1Q8IV76 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PASD1Q8IV76 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PASD1Q8IV76 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PASD1Q8IV76 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PASD1Q8IV76 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PASD1Q8IV76 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PASD1Q8IV76 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PASD1Q8IV76 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PASD1Q8IV76 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PASD1Q8IV76 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PASD1Q8IV76 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PASD1Q8IV76 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PASD1Q8IV76 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PASD1Q8IV76 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PASD1Q8IV76 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PASD1Q8IV76 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PASD1Q8IV76 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PASD1Q8IV76 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PASD1Q8IV76 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PASD1Q8IV76 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PASD1Q8IV76 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PASD1Q8IV76 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PASD1Q8IV76 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PASD1Q8IV76 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PASD1Q8IV76 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PASD1Q8IV76 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PASD1Q8IV76 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PASD1Q8IV76 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PASD1Q8IV76 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PASD1Q8IV76 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PASD1Q8IV76 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PASD1Q8IV76 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PASD1Q8IV76 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PASD1Q8IV76 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PASD1Q8IV76 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PASD1Q8IV76 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PASD1Q8IV76 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PASD1Q8IV76 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PASD1Q8IV76 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PASD1Q8IV76 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PASD1Q8IV76 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PASD1Q8IV76 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PASD1Q8IV76 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PASD1Q8IV76 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PASD1Q8IV76 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PASD1Q8IV76 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PASD1Q8IV76 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PASD1Q8IV76 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PASD1Q8IV76 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PASD1Q8IV76 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PASD1Q8IV76 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms