Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
WDR49Q8IV35 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
WDR49Q8IV35 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
WDR49Q8IV35 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
WDR49Q8IV35 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
WDR49Q8IV35 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
WDR49Q8IV35 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms