Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAB11FIP4Q86YS3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAB11FIP4Q86YS3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RAB11FIP4Q86YS3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAB11FIP4Q86YS3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAB11FIP4Q86YS3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAB11FIP4Q86YS3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAB11FIP4Q86YS3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
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RAB11FIP4Q86YS3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAB11FIP4Q86YS3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
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RAB11FIP4Q86YS3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAB11FIP4Q86YS3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAB11FIP4Q86YS3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAB11FIP4Q86YS3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RAB11FIP4Q86YS3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RAB11FIP4Q86YS3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
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RAB11FIP4Q86YS3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAB11FIP4Q86YS3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAB11FIP4Q86YS3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAB11FIP4Q86YS3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAB11FIP4Q86YS3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAB11FIP4Q86YS3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
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RAB11FIP4Q86YS3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAB11FIP4Q86YS3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAB11FIP4Q86YS3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAB11FIP4Q86YS3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAB11FIP4Q86YS3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
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RAB11FIP4Q86YS3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAB11FIP4Q86YS3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
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RAB11FIP4Q86YS3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
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RAB11FIP4Q86YS3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RAB11FIP4Q86YS3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
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RAB11FIP4Q86YS3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
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RAB11FIP4Q86YS3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAB11FIP4Q86YS3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
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RAB11FIP4Q86YS3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAB11FIP4Q86YS3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB11FIP4Q86YS3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB11FIP4Q86YS3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB11FIP4Q86YS3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB11FIP4Q86YS3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAB11FIP4Q86YS3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAB11FIP4Q86YS3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAB11FIP4Q86YS3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAB11FIP4Q86YS3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAB11FIP4Q86YS3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAB11FIP4Q86YS3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAB11FIP4Q86YS3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAB11FIP4Q86YS3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAB11FIP4Q86YS3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAB11FIP4Q86YS3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAB11FIP4Q86YS3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RAB11FIP4Q86YS3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB11FIP4Q86YS3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB11FIP4Q86YS3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB11FIP4Q86YS3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB11FIP4Q86YS3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB11FIP4Q86YS3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RAB11FIP4Q86YS3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
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