Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDR53Q7Z5U6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WDR53Q7Z5U6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WDR53Q7Z5U6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WDR53Q7Z5U6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms