Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ATG9BQ674R7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATG9BQ674R7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATG9BQ674R7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATG9BQ674R7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms