Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE5

KRT79, Keratin, type II cytoskeletal 79, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT79Q5XKE5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT79Q5XKE5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT79Q5XKE5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT79Q5XKE5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT79Q5XKE5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT79Q5XKE5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT79Q5XKE5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT79Q5XKE5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT79Q5XKE5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT79Q5XKE5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT79Q5XKE5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT79Q5XKE5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT79Q5XKE5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT79Q5XKE5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
KRT79Q5XKE5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT79Q5XKE5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms