Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDHAF4Q5VUM1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDHAF4Q5VUM1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SDHAF4Q5VUM1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SDHAF4Q5VUM1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SDHAF4Q5VUM1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SDHAF4Q5VUM1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDHAF4Q5VUM1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDHAF4Q5VUM1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDHAF4Q5VUM1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SDHAF4Q5VUM1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SDHAF4Q5VUM1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDHAF4Q5VUM1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SDHAF4Q5VUM1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDHAF4Q5VUM1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDHAF4Q5VUM1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDHAF4Q5VUM1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDHAF4Q5VUM1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDHAF4Q5VUM1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDHAF4Q5VUM1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDHAF4Q5VUM1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SDHAF4Q5VUM1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SDHAF4Q5VUM1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SDHAF4Q5VUM1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SDHAF4Q5VUM1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SDHAF4Q5VUM1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDHAF4Q5VUM1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDHAF4Q5VUM1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDHAF4Q5VUM1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDHAF4Q5VUM1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SDHAF4Q5VUM1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDHAF4Q5VUM1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms