Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WASHC2DQ5SRD0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
WASHC2DQ5SRD0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WASHC2DQ5SRD0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
WASHC2DQ5SRD0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms