Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PCGF3Q3KNV8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PCGF3Q3KNV8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCGF3Q3KNV8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCGF3Q3KNV8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms