Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GEN1Q17RS7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GEN1Q17RS7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GEN1Q17RS7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
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