Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIF1AQ16665 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIF1AQ16665 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIF1AQ16665 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIF1AQ16665 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIF1AQ16665 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIF1AQ16665 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIF1AQ16665 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HIF1AQ16665 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIF1AQ16665 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIF1AQ16665 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIF1AQ16665 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIF1AQ16665 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIF1AQ16665 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HIF1AQ16665 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HIF1AQ16665 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HIF1AQ16665 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HIF1AQ16665 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HIF1AQ16665 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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