Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC1AQ14683 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC1AQ14683 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC1AQ14683 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC1AQ14683 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC1AQ14683 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC1AQ14683 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC1AQ14683 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMC1AQ14683 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC1AQ14683 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC1AQ14683 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC1AQ14683 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC1AQ14683 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC1AQ14683 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC1AQ14683 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC1AQ14683 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC1AQ14683 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC1AQ14683 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC1AQ14683 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC1AQ14683 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMC1AQ14683 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMC1AQ14683 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMC1AQ14683 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
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