Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNW1Q13573 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNW1Q13573 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SNW1Q13573 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNW1Q13573 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNW1Q13573 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNW1Q13573 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNW1Q13573 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNW1Q13573 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNW1Q13573 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNW1Q13573 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNW1Q13573 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNW1Q13573 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNW1Q13573 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNW1Q13573 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNW1Q13573 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNW1Q13573 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNW1Q13573 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNW1Q13573 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNW1Q13573 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNW1Q13573 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNW1Q13573 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNW1Q13573 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNW1Q13573 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNW1Q13573 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNW1Q13573 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNW1Q13573 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNW1Q13573 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNW1Q13573 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNW1Q13573 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SNW1Q13573 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SNW1Q13573 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNW1Q13573 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNW1Q13573 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNW1Q13573 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNW1Q13573 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNW1Q13573 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms