Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRDNQ13061 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRDNQ13061 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRDNQ13061 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRDNQ13061 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRDNQ13061 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRDNQ13061 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRDNQ13061 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRDNQ13061 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TRDNQ13061 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRDNQ13061 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TRDNQ13061 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TRDNQ13061 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRDNQ13061 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRDNQ13061 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRDNQ13061 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRDNQ13061 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRDNQ13061 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRDNQ13061 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRDNQ13061 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRDNQ13061 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRDNQ13061 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRDNQ13061 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRDNQ13061 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRDNQ13061 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRDNQ13061 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TRDNQ13061 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRDNQ13061 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRDNQ13061 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRDNQ13061 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRDNQ13061 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRDNQ13061 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRDNQ13061 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRDNQ13061 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRDNQ13061 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRDNQ13061 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRDNQ13061 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRDNQ13061 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRDNQ13061 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRDNQ13061 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRDNQ13061 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRDNQ13061 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRDNQ13061 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRDNQ13061 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRDNQ13061 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRDNQ13061 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRDNQ13061 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRDNQ13061 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRDNQ13061 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRDNQ13061 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRDNQ13061 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
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