Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNG1Q06432 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNG1Q06432 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CACNG1Q06432 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACNG1Q06432 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACNG1Q06432 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNG1Q06432 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNG1Q06432 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms