Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CASP7P55210 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CASP7P55210 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CASP7P55210 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CASP7P55210 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CASP7P55210 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CASP7P55210 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CASP7P55210 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CASP7P55210 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CASP7P55210 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CASP7P55210 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CASP7P55210 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CASP7P55210 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CASP7P55210 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CASP7P55210 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CASP7P55210 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CASP7P55210 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CASP7P55210 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CASP7P55210 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CASP7P55210 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CASP7P55210 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CASP7P55210 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CASP7P55210 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CASP7P55210 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
CASP7P55210 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CASP7P55210 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CASP7P55210 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CASP7P55210 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CASP7P55210 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CASP7P55210 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CASP7P55210 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CASP7P55210 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CASP7P55210 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CASP7P55210 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CASP7P55210 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CASP7P55210 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CASP7P55210 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CASP7P55210 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CASP7P55210 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CASP7P55210 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CASP7P55210 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CASP7P55210 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CASP7P55210 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CASP7P55210 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CASP7P55210 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CASP7P55210 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CASP7P55210 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CASP7P55210 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CASP7P55210 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CASP7P55210 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CASP7P55210 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CASP7P55210 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CASP7P55210 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CASP7P55210 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CASP7P55210 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CASP7P55210 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CASP7P55210 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CASP7P55210 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CASP7P55210 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CASP7P55210 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CASP7P55210 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CASP7P55210 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CASP7P55210 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CASP7P55210 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CASP7P55210 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CASP7P55210 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CASP7P55210 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CASP7P55210 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CASP7P55210 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CASP7P55210 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CASP7P55210 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CASP7P55210 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CASP7P55210 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CASP7P55210 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CASP7P55210 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
CASP7P55210 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CASP7P55210 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CASP7P55210 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CASP7P55210 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CASP7P55210 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CASP7P55210 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CASP7P55210 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CASP7P55210 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CASP7P55210 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CASP7P55210 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CASP7P55210 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CASP7P55210 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CASP7P55210 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CASP7P55210 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CASP7P55210 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CASP7P55210 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CASP7P55210 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CASP7P55210 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CASP7P55210 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CASP7P55210 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CASP7P55210 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CASP7P55210 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CASP7P55210 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CASP7P55210 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CASP7P55210 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms