Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF135P52742 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF135P52742 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZNF135P52742 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF135P52742 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF135P52742 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF135P52742 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF135P52742 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF135P52742 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF135P52742 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF135P52742 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms