Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KPNA2P52292 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KPNA2P52292 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KPNA2P52292 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KPNA2P52292 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KPNA2P52292 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KPNA2P52292 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KPNA2P52292 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KPNA2P52292 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KPNA2P52292 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KPNA2P52292 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KPNA2P52292 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KPNA2P52292 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KPNA2P52292 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KPNA2P52292 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KPNA2P52292 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KPNA2P52292 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KPNA2P52292 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KPNA2P52292 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KPNA2P52292 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KPNA2P52292 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KPNA2P52292 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KPNA2P52292 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms