Protein–RNA interactions for Protein: P51685

CCR8, C-C chemokine receptor type 8, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR8P51685 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCR8P51685 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCR8P51685 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCR8P51685 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCR8P51685 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCR8P51685 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCR8P51685 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCR8P51685 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR8P51685 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR8P51685 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR8P51685 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR8P51685 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR8P51685 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR8P51685 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR8P51685 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCR8P51685 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCR8P51685 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCR8P51685 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCR8P51685 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCR8P51685 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCR8P51685 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR8P51685 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR8P51685 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR8P51685 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR8P51685 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR8P51685 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCR8P51685 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCR8P51685 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCR8P51685 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCR8P51685 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCR8P51685 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCR8P51685 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR8P51685 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR8P51685 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR8P51685 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR8P51685 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR8P51685 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR8P51685 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR8P51685 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR8P51685 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR8P51685 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR8P51685 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCR8P51685 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCR8P51685 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCR8P51685 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCR8P51685 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCR8P51685 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCR8P51685 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCR8P51685 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR8P51685 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR8P51685 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR8P51685 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR8P51685 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR8P51685 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCR8P51685 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCR8P51685 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCR8P51685 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCR8P51685 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCR8P51685 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCR8P51685 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCR8P51685 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCR8P51685 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCR8P51685 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCR8P51685 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCR8P51685 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCR8P51685 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCR8P51685 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCR8P51685 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCR8P51685 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCR8P51685 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCR8P51685 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR8P51685 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR8P51685 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR8P51685 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR8P51685 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR8P51685 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCR8P51685 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCR8P51685 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR8P51685 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR8P51685 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR8P51685 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR8P51685 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR8P51685 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR8P51685 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR8P51685 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCR8P51685 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR8P51685 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR8P51685 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR8P51685 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR8P51685 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR8P51685 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR8P51685 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR8P51685 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR8P51685 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR8P51685 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCR8P51685 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR8P51685 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR8P51685 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCR8P51685 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCR8P51685 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.4 ms