Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPAP49450 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPAP49450 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CENPAP49450 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPAP49450 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPAP49450 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPAP49450 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPAP49450 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CENPAP49450 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPAP49450 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPAP49450 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPAP49450 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPAP49450 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPAP49450 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPAP49450 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPAP49450 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CENPAP49450 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CENPAP49450 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPAP49450 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPAP49450 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPAP49450 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CENPAP49450 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPAP49450 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPAP49450 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPAP49450 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CENPAP49450 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPAP49450 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPAP49450 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPAP49450 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CENPAP49450 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPAP49450 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPAP49450 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPAP49450 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPAP49450 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPAP49450 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPAP49450 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPAP49450 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPAP49450 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPAP49450 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CENPAP49450 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPAP49450 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPAP49450 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPAP49450 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CENPAP49450 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPAP49450 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPAP49450 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPAP49450 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CENPAP49450 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CENPAP49450 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CENPAP49450 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CENPAP49450 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPAP49450 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CENPAP49450 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPAP49450 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPAP49450 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPAP49450 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPAP49450 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPAP49450 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CENPAP49450 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPAP49450 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPAP49450 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPAP49450 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPAP49450 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPAP49450 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPAP49450 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPAP49450 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPAP49450 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPAP49450 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPAP49450 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPAP49450 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CENPAP49450 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPAP49450 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPAP49450 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPAP49450 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPAP49450 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPAP49450 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPAP49450 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPAP49450 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPAP49450 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPAP49450 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPAP49450 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPAP49450 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPAP49450 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPAP49450 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPAP49450 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPAP49450 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPAP49450 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPAP49450 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPAP49450 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPAP49450 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPAP49450 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPAP49450 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPAP49450 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPAP49450 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPAP49450 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPAP49450 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPAP49450 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPAP49450 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPAP49450 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPAP49450 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms