Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ECI1P42126 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECI1P42126 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECI1P42126 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECI1P42126 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECI1P42126 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ECI1P42126 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECI1P42126 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECI1P42126 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECI1P42126 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECI1P42126 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECI1P42126 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECI1P42126 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECI1P42126 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECI1P42126 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECI1P42126 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECI1P42126 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECI1P42126 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECI1P42126 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ECI1P42126 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECI1P42126 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECI1P42126 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ECI1P42126 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECI1P42126 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ECI1P42126 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ECI1P42126 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECI1P42126 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECI1P42126 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECI1P42126 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ECI1P42126 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ECI1P42126 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECI1P42126 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECI1P42126 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECI1P42126 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECI1P42126 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECI1P42126 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ECI1P42126 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECI1P42126 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECI1P42126 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECI1P42126 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECI1P42126 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ECI1P42126 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECI1P42126 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECI1P42126 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECI1P42126 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECI1P42126 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECI1P42126 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ECI1P42126 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECI1P42126 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECI1P42126 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECI1P42126 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECI1P42126 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECI1P42126 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECI1P42126 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ECI1P42126 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECI1P42126 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ECI1P42126 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECI1P42126 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECI1P42126 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECI1P42126 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECI1P42126 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECI1P42126 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECI1P42126 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECI1P42126 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECI1P42126 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ECI1P42126 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ECI1P42126 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECI1P42126 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECI1P42126 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECI1P42126 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECI1P42126 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECI1P42126 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECI1P42126 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECI1P42126 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECI1P42126 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ECI1P42126 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECI1P42126 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECI1P42126 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECI1P42126 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECI1P42126 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECI1P42126 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ECI1P42126 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECI1P42126 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECI1P42126 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECI1P42126 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECI1P42126 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECI1P42126 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECI1P42126 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ECI1P42126 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECI1P42126 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECI1P42126 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECI1P42126 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECI1P42126 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECI1P42126 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ECI1P42126 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ECI1P42126 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECI1P42126 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECI1P42126 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECI1P42126 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ECI1P42126 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms