Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SERPINF1P36955 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SERPINF1P36955 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SERPINF1P36955 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SERPINF1P36955 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINF1P36955 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINF1P36955 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINF1P36955 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINF1P36955 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINF1P36955 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINF1P36955 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINF1P36955 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINF1P36955 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINF1P36955 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINF1P36955 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINF1P36955 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SERPINF1P36955 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINF1P36955 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINF1P36955 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SERPINF1P36955 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINF1P36955 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINF1P36955 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINF1P36955 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINF1P36955 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SERPINF1P36955 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINF1P36955 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINF1P36955 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINF1P36955 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINF1P36955 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINF1P36955 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINF1P36955 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SERPINF1P36955 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SERPINF1P36955 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms