Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DESP17661 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DESP17661 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DESP17661 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
DESP17661 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DESP17661 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DESP17661 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
DESP17661 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DESP17661 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DESP17661 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DESP17661 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DESP17661 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DESP17661 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DESP17661 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DESP17661 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DESP17661 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DESP17661 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DESP17661 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DESP17661 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DESP17661 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
DESP17661 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DESP17661 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
DESP17661 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DESP17661 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DESP17661 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DESP17661 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DESP17661 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DESP17661 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DESP17661 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DESP17661 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DESP17661 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DESP17661 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DESP17661 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DESP17661 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DESP17661 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DESP17661 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DESP17661 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DESP17661 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DESP17661 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DESP17661 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DESP17661 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DESP17661 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DESP17661 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DESP17661 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DESP17661 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DESP17661 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DESP17661 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DESP17661 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DESP17661 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DESP17661 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DESP17661 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DESP17661 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DESP17661 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DESP17661 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DESP17661 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DESP17661 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DESP17661 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DESP17661 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
DESP17661 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DESP17661 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DESP17661 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DESP17661 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DESP17661 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DESP17661 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
DESP17661 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
DESP17661 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DESP17661 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
DESP17661 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DESP17661 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DESP17661 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DESP17661 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DESP17661 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DESP17661 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DESP17661 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DESP17661 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DESP17661 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DESP17661 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DESP17661 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DESP17661 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DESP17661 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DESP17661 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DESP17661 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DESP17661 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DESP17661 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DESP17661 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DESP17661 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DESP17661 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DESP17661 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DESP17661 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
DESP17661 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DESP17661 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DESP17661 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DESP17661 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DESP17661 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DESP17661 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DESP17661 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DESP17661 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DESP17661 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
DESP17661 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DESP17661 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.1 ms