Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRGAP2CP0DJJ0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP2CP0DJJ0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP2CP0DJJ0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP2CP0DJJ0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP2CP0DJJ0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP2CP0DJJ0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP2CP0DJJ0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP2CP0DJJ0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP2CP0DJJ0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP2CP0DJJ0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP2CP0DJJ0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP2CP0DJJ0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP2CP0DJJ0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP2CP0DJJ0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP2CP0DJJ0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP2CP0DJJ0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP2CP0DJJ0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRGAP2CP0DJJ0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRGAP2CP0DJJ0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRGAP2CP0DJJ0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRGAP2CP0DJJ0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRGAP2CP0DJJ0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRGAP2CP0DJJ0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRGAP2CP0DJJ0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRGAP2CP0DJJ0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRGAP2CP0DJJ0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRGAP2CP0DJJ0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRGAP2CP0DJJ0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP2CP0DJJ0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP2CP0DJJ0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP2CP0DJJ0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP2CP0DJJ0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP2CP0DJJ0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP2CP0DJJ0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP2CP0DJJ0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP2CP0DJJ0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP2CP0DJJ0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP2CP0DJJ0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP2CP0DJJ0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP2CP0DJJ0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SRGAP2CP0DJJ0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRGAP2CP0DJJ0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SRGAP2CP0DJJ0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRGAP2CP0DJJ0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRGAP2CP0DJJ0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SRGAP2CP0DJJ0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP2CP0DJJ0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP2CP0DJJ0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP2CP0DJJ0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP2CP0DJJ0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP2CP0DJJ0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP2CP0DJJ0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP2CP0DJJ0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP2CP0DJJ0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP2CP0DJJ0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP2CP0DJJ0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SRGAP2CP0DJJ0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP2CP0DJJ0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP2CP0DJJ0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP2CP0DJJ0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP2CP0DJJ0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP2CP0DJJ0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP2CP0DJJ0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP2CP0DJJ0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SRGAP2CP0DJJ0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP2CP0DJJ0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP2CP0DJJ0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SRGAP2CP0DJJ0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRGAP2CP0DJJ0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRGAP2CP0DJJ0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRGAP2CP0DJJ0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRGAP2CP0DJJ0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRGAP2CP0DJJ0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SRGAP2CP0DJJ0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SRGAP2CP0DJJ0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRGAP2CP0DJJ0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.6 ms