Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IFNB1P01574 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
IFNB1P01574 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFNB1P01574 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.6 ms