Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRAMEF1O95521 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF1O95521 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF1O95521 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms