Protein–RNA interactions for Protein: O75367

H2AFY, Core histone macro-H2A.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFYO75367 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFYO75367 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
H2AFYO75367 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2AFYO75367 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2AFYO75367 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2AFYO75367 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFYO75367 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFYO75367 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFYO75367 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFYO75367 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFYO75367 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFYO75367 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFYO75367 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFYO75367 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFYO75367 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFYO75367 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFYO75367 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFYO75367 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFYO75367 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFYO75367 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFYO75367 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2AFYO75367 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2AFYO75367 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2AFYO75367 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2AFYO75367 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2AFYO75367 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2AFYO75367 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
H2AFYO75367 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms