Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCNT1O60563 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCNT1O60563 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CCNT1O60563 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCNT1O60563 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCNT1O60563 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCNT1O60563 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCNT1O60563 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCNT1O60563 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNT1O60563 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCNT1O60563 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCNT1O60563 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCNT1O60563 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCNT1O60563 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms