Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CLDN34H7C241 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLDN34H7C241 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CLDN34H7C241 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms