Protein–RNA interactions for Protein: H3BM21

Integrin beta (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BM21 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BM21 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H3BM21 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BM21 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BM21 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BM21 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BM21 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H3BM21 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BM21 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BM21 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BM21 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BM21 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BM21 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BM21 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
H3BM21 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BM21 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BM21 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BM21 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BM21 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BM21 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BM21 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BM21 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BM21 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H3BM21 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BM21 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BM21 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BM21 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BM21 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BM21 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BM21 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BM21 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BM21 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H3BM21 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BM21 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BM21 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BM21 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BM21 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BM21 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BM21 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BM21 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BM21 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BM21 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H3BM21 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
H3BM21 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
H3BM21 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BM21 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BM21 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BM21 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H3BM21 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BM21 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BM21 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BM21 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BM21 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BM21 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BM21 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BM21 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
H3BM21 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BM21 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BM21 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BM21 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BM21 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BM21 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BM21 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BM21 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BM21 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BM21 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BM21 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BM21 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BM21 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BM21 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BM21 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BM21 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BM21 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BM21 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BM21 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BM21 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BM21 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
H3BM21 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BM21 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BM21 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BM21 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BM21 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BM21 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BM21 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BM21 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BM21 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BM21 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BM21 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BM21 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BM21 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BM21 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BM21 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BM21 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BM21 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BM21 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BM21 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BM21 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BM21 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BM21 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BM21 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms