Protein–RNA interactions for Protein: A2A3L6

TTC24, Tetratricopeptide repeat protein 24, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC24A2A3L6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC24A2A3L6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC24A2A3L6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC24A2A3L6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC24A2A3L6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC24A2A3L6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC24A2A3L6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC24A2A3L6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC24A2A3L6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC24A2A3L6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC24A2A3L6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC24A2A3L6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC24A2A3L6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC24A2A3L6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC24A2A3L6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC24A2A3L6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC24A2A3L6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TTC24A2A3L6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TTC24A2A3L6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TTC24A2A3L6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC24A2A3L6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC24A2A3L6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC24A2A3L6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC24A2A3L6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC24A2A3L6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC24A2A3L6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC24A2A3L6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC24A2A3L6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC24A2A3L6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC24A2A3L6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC24A2A3L6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC24A2A3L6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC24A2A3L6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC24A2A3L6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC24A2A3L6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC24A2A3L6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms