Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J9

TAF6L, TAF6-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 6L, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6LQ9Y6J9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TAF6LQ9Y6J9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TAF6LQ9Y6J9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TAF6LQ9Y6J9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TAF6LQ9Y6J9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TAF6LQ9Y6J9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TAF6LQ9Y6J9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TAF6LQ9Y6J9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TAF6LQ9Y6J9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TAF6LQ9Y6J9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TAF6LQ9Y6J9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TAF6LQ9Y6J9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TAF6LQ9Y6J9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TAF6LQ9Y6J9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TAF6LQ9Y6J9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TAF6LQ9Y6J9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TAF6LQ9Y6J9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TAF6LQ9Y6J9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TAF6LQ9Y6J9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TAF6LQ9Y6J9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TAF6LQ9Y6J9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TAF6LQ9Y6J9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TAF6LQ9Y6J9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TAF6LQ9Y6J9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TAF6LQ9Y6J9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TAF6LQ9Y6J9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TAF6LQ9Y6J9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TAF6LQ9Y6J9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TAF6LQ9Y6J9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TAF6LQ9Y6J9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TAF6LQ9Y6J9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TAF6LQ9Y6J9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TAF6LQ9Y6J9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TAF6LQ9Y6J9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TAF6LQ9Y6J9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TAF6LQ9Y6J9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TAF6LQ9Y6J9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TAF6LQ9Y6J9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TAF6LQ9Y6J9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TAF6LQ9Y6J9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TAF6LQ9Y6J9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TAF6LQ9Y6J9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TAF6LQ9Y6J9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms