Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEU3Q9UQ49 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEU3Q9UQ49 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEU3Q9UQ49 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEU3Q9UQ49 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEU3Q9UQ49 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEU3Q9UQ49 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEU3Q9UQ49 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEU3Q9UQ49 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEU3Q9UQ49 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEU3Q9UQ49 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEU3Q9UQ49 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEU3Q9UQ49 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEU3Q9UQ49 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEU3Q9UQ49 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEU3Q9UQ49 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEU3Q9UQ49 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEU3Q9UQ49 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NEU3Q9UQ49 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEU3Q9UQ49 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEU3Q9UQ49 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NEU3Q9UQ49 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEU3Q9UQ49 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEU3Q9UQ49 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEU3Q9UQ49 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEU3Q9UQ49 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEU3Q9UQ49 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEU3Q9UQ49 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEU3Q9UQ49 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEU3Q9UQ49 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms