Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULJ8

PPP1R9A, Neurabin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9AQ9ULJ8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPP1R9AQ9ULJ8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPP1R9AQ9ULJ8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PPP1R9AQ9ULJ8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPP1R9AQ9ULJ8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PPP1R9AQ9ULJ8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PPP1R9AQ9ULJ8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPP1R9AQ9ULJ8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPP1R9AQ9ULJ8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPP1R9AQ9ULJ8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPP1R9AQ9ULJ8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPP1R9AQ9ULJ8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PPP1R9AQ9ULJ8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPP1R9AQ9ULJ8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPP1R9AQ9ULJ8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPP1R9AQ9ULJ8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPP1R9AQ9ULJ8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPP1R9AQ9ULJ8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPP1R9AQ9ULJ8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPP1R9AQ9ULJ8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPP1R9AQ9ULJ8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPP1R9AQ9ULJ8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPP1R9AQ9ULJ8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPP1R9AQ9ULJ8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPP1R9AQ9ULJ8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPP1R9AQ9ULJ8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPP1R9AQ9ULJ8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPP1R9AQ9ULJ8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPP1R9AQ9ULJ8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPP1R9AQ9ULJ8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP1R9AQ9ULJ8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP1R9AQ9ULJ8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP1R9AQ9ULJ8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP1R9AQ9ULJ8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP1R9AQ9ULJ8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP1R9AQ9ULJ8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP1R9AQ9ULJ8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP1R9AQ9ULJ8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPP1R9AQ9ULJ8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP1R9AQ9ULJ8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP1R9AQ9ULJ8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms