Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL51

HCN2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN2Q9UL51 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HCN2Q9UL51 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HCN2Q9UL51 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HCN2Q9UL51 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HCN2Q9UL51 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HCN2Q9UL51 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HCN2Q9UL51 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HCN2Q9UL51 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HCN2Q9UL51 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HCN2Q9UL51 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HCN2Q9UL51 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HCN2Q9UL51 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HCN2Q9UL51 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HCN2Q9UL51 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HCN2Q9UL51 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HCN2Q9UL51 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HCN2Q9UL51 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HCN2Q9UL51 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HCN2Q9UL51 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HCN2Q9UL51 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HCN2Q9UL51 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HCN2Q9UL51 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HCN2Q9UL51 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HCN2Q9UL51 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HCN2Q9UL51 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HCN2Q9UL51 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HCN2Q9UL51 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HCN2Q9UL51 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HCN2Q9UL51 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HCN2Q9UL51 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HCN2Q9UL51 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HCN2Q9UL51 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HCN2Q9UL51 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HCN2Q9UL51 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HCN2Q9UL51 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HCN2Q9UL51 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HCN2Q9UL51 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HCN2Q9UL51 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms