Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL6Q9UKU0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL6Q9UKU0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL6Q9UKU0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL6Q9UKU0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSL6Q9UKU0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSL6Q9UKU0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSL6Q9UKU0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSL6Q9UKU0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSL6Q9UKU0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSL6Q9UKU0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSL6Q9UKU0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL6Q9UKU0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL6Q9UKU0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL6Q9UKU0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSL6Q9UKU0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSL6Q9UKU0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSL6Q9UKU0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSL6Q9UKU0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSL6Q9UKU0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSL6Q9UKU0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACSL6Q9UKU0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACSL6Q9UKU0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACSL6Q9UKU0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACSL6Q9UKU0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ACSL6Q9UKU0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms