Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GTF3C4Q9UKN8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF3C4Q9UKN8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF3C4Q9UKN8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GTF3C4Q9UKN8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C4Q9UKN8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C4Q9UKN8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C4Q9UKN8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C4Q9UKN8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GTF3C4Q9UKN8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF3C4Q9UKN8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF3C4Q9UKN8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GTF3C4Q9UKN8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF3C4Q9UKN8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF3C4Q9UKN8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF3C4Q9UKN8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF3C4Q9UKN8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF3C4Q9UKN8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GTF3C4Q9UKN8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C4Q9UKN8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C4Q9UKN8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C4Q9UKN8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GTF3C4Q9UKN8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF3C4Q9UKN8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF3C4Q9UKN8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF3C4Q9UKN8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF3C4Q9UKN8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF3C4Q9UKN8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GTF3C4Q9UKN8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF3C4Q9UKN8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF3C4Q9UKN8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF3C4Q9UKN8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF3C4Q9UKN8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF3C4Q9UKN8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4Q9UKN8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4Q9UKN8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4Q9UKN8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF3C4Q9UKN8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF3C4Q9UKN8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF3C4Q9UKN8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF3C4Q9UKN8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF3C4Q9UKN8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF3C4Q9UKN8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF3C4Q9UKN8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C4Q9UKN8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C4Q9UKN8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C4Q9UKN8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C4Q9UKN8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C4Q9UKN8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF3C4Q9UKN8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF3C4Q9UKN8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF3C4Q9UKN8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF3C4Q9UKN8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF3C4Q9UKN8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF3C4Q9UKN8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF3C4Q9UKN8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF3C4Q9UKN8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF3C4Q9UKN8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF3C4Q9UKN8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GTF3C4Q9UKN8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.6 ms