Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VPREB3Q9UKI3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VPREB3Q9UKI3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
VPREB3Q9UKI3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VPREB3Q9UKI3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms