Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMYD2Q9NRG4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMYD2Q9NRG4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMYD2Q9NRG4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD2Q9NRG4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms